中国肿瘤基因组研究协作组确定，胃癌是我国研究员首选的癌症类型，因为我国是胃癌大国。癌症基因组研究的首要工作是采集高质量的生物样本，而在胃癌方面，北京肿瘤医院做过多年的系统的样本采集和随访工作，具有独特的癌症样本资源优势，经过近10年的努力，该院标本库已收集了大量高质量并具备多年随访资料的生物样本。

最新的第二代DNA测序技术，也为基因组分析奠定了基础。深圳华大基因研究院的相关负责人告诉记者，华大基因曾参与了名声显赫的“人类基因组计划”，经过多年的基因研究积累，已建成大规模测序平台，拥有高效的生物信息分析和创新的基因健康医疗诊断技术，成为世界上最大的新一代测序中心。

“我们从一个胃癌患者的身上，提取癌症组织，通过使用最新的DNA测序技术，对其进行解码，在与正常人的基因组进行对比后，如果能够发现两者之间的不同之处，就可以确定究竟哪些基因的异常变化导致了疾病的发生。”吕有勇说，目前，胃癌基因分析的初步数据，已经提交到“国际肿瘤基因组协作组”数据库，其他国家的一些研究成果，也都能在国际癌症基因组内部共享。“几乎每天，我们都会与世界各国同仁交流工作。”

就在科学家们热火朝天地破译癌症基因密码的时候，彭博新闻社（Bloomberg News）一篇讨论癌症基因组计划性价比的文章在近期发表——《科学家说，肿瘤基因组研究难达目标》（Genome cancer research falls short, scientist says），文章提到了相关科学家对该计划的质疑：比如，癌症基因组也许只是产生大量无用数据，并不能加深人们对癌症的理解。有专家认为肿瘤只是一类疾病，不是一个物种，因此根本谈不上基因组。另外，癌症细胞中的基因大部分都正常，只有少部分发生突变，为此就要进行整个基因组的测序研究，是劳民伤财的项目，造成研究经费的巨大浪费。